El Santuario Nacional Megantoni está ubicado en parte del distrito de Echarate, provincia de La Convención en el departamento de Cusco en el Perú.

En la parte baja del Santuario está el pongo de Mainique es un escenario natural de belleza sobrecogedora, un estrechamiento del río Urubamba formado por dos inmensas paredes de rocas en las que abundan cataratas, mariposas, guacamayos, peces. En sus playas de arena blanca viven los Machiguenga quienes pasan días y noches, pescando y durmiendo bajo las estrellas. Pero nadie más se atreve a vivir por allí, pues es un lugar que ellos siempre han considerado sagrado, un lugar que aman, respetan y temen.

En la parte alta del Santuario se encuentra el Lago de Angel cuyo emisario forma uno de los afluentes del Río Timpía, un afluente del Río Urubamba.

El Santuario Nacional Megantoni se encontró más de 60 especies nuevas. Se hallaron 73 de las 120 especies de escarabajos peloteros y cerca de 22 especies de peces de las 70 calculadas. Algunas de las especies de peces de altura podrían ser endémicas en la región.

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